多年来，《文史哲》始终坚持学术性、人文性、开放性的办刊宗旨和特点，注重刊发采纳新材料、提出新观点、运用新方法、开拓新领域的学术力作；积极开展能够促进学术进步的理论争鸣；注重发现和扶植学术新人；依托于山东大学文史见长的学科优势，强化人文特色和追求厚重的办刊传统，期刊的学术含量不断提高，国学特色更加鲜明，因此，为海外汉学研究机构和学者所看重，海外订户始终保持在每期150-190份的范围，名列国内综合性人文社会科学学术期刊前列。

2003年入选“名刊工程”以来，《文史哲》确定了“昌明传统学术，锻铸人文新知；植根汉语世界，融入全球文明”的办刊理念；进一步明确了发展定位，即走半专业化的“小综合”之路，集中优势栏目与编辑力量于人文学科，最终办成在海内外汉学领域享有声誉的名刊。经过几年的努力，初步形成了以“人文前沿”、“疑古与释古”、“当代学术纵览”等特色栏目为主干的风格体系，引起学界瞩目。

2005年5月12日《光明日报》“书评周刊”专栏发表长文，对《文史哲》“人文前沿”专栏的专题文章进行了系统评述。

在“人文前沿”成功推出的基础上，《文史哲》又倾力打造了“疑古与释古”这一特色栏目。自2006年第2期开设“疑古与释古”专栏，已连续十余期、刊发近20篇论文，对近年来在史学界极具影响力的“走出疑古时代”进行专题讨论，引起了海内外学术界的热烈反响。这一讨论被《社会科学》杂志（上海）评为2006年度四大人文学术热点之一，与“马克思主义的当代价值”、“新国学”、“《文学概论》教材与文学理论的基本问题”等学术话题和文化事件并列，共同组成2006年的文化镜像和学术奇观。